Прежде чем приступить к устройству института, Е.Л. Зубашев совершил ознакомительную поездку по Сибири, встретился с томскими купцами и промышленниками. Ефиму Лукьяновичу стало очевидно, что предусмотренный Министерством народного просвещения Институт практических инженеров с двумя отделениями не удовлетворит запросы местной промышленности, потребности в специалистах Сибирской железной дороги и положительно не повлияет на развитие водного транспорта. Не будет удовлетворена и необходимость обустройства огромного пространства вдоль Великого Сибирского пути.
Он составил новый проект учебного плана института, подробную объяснительную записку к нему и представил их в Министерство. В его видении нового института положительно сказались разностороннее образование: классическое и технологическое, опыт ученого и промышленника.
В Записке Зубашев доказал преимущество высшей технической школы политехнического типа по сравнению с обычным техническим вузом. Учитывая потребности развивающейся экономики Сибири в специалистах, он предложил, кроме двух утвержденных отделений – механического и химического, открыть дополнительно еще два – горное и инженерно-строительное. Это предложение нашло поддержку в Министерстве просвещения и было утверждено Государственным Советом.
В Записке были высказаны новые взгляды на систему преподавания в вузе: развитие специализации, разделение учебных дисциплин на общие и факультативные, широкое введение практических занятий вместо традиционных в технических вузах репетиций, представление оканчивающими курс обучения, кроме дипломных проектов, дипломных работ по результатам самостоятельных научных исследований, оснащение учебных мастерских, лабораторий и кабинетов новейшим оборудованием и использование их не только в узко учебных целях, но и для проведения опытов, исследований в целях развития технических знаний и приложения их к освоению природных богатств Сибири. Он отстоял в Министерстве право Совета института распоряжаться своими специальными средствами, что дало возможность использовать их на улучшение учебного дела.
Объяснительная записка к учебному плану