В Петербурге Ефим Лукьянович снял квартиру у Грибоедовского канала на Английском проспекте в доме № 34. Их квартира № 4 из 16 комнат занимала весь 2-й этаж. Вместе с родителями жили обе дочери с семьями.

Статский советник Ефим Лукьянович Зубашев, имея за плечами многолетний опыт гласного Томской городской Думы и другой общественной деятельности, начал карьеру государственного деятеля на посту члена Государственного Совета.

В Государственном Совете Ефим Лукьянович работал в Департаменте государственной экономии, занимавшемся вопросами финансов, промышленности, науки и торговли. Принимал деятельное участие в работах различных комиссий и выступал на общих собраниях Государственного Совета по вопросам технического образования, а также по экономическим вопросам, связанным, главным образом, с сибирским регионом.

С самого начала Первой мировой войны (1914 г.) Ефим Лукьянович и Ольга Александровна помогали раненым денежными пожертвованиями. Ольга Александровна вместе с зятем Борисом Николаевичем Перетц, не попавшим на фронт из-за плохого зрения, работали в госпиталях.

В 1915 году по инициативе Е.Л. Зубашева при Совете съездов представителей биржевой торговли и сельского хозяйства образовалось Сибирское бюро под его председательством. Бюро занималось разработкой вопросов, касающихся торговли и промышленности Сибири. Был разработан в том числе «План железнодорожного строительства в Сибири на ближайшие 10 лет». Для Ефима Лукьяновича это было продолжением его большой работы, начатой еще в Томске в Обществе сибирских инженеров. Профессор отстаивал проект строительства железной дороги, которая соединила бы Барнаул с Томском прямым путем. Этот план был полностью одобрен, принят в 1916 г. Министерством путей сообщения и был опубликован Е.Л. Зубашевым отдельной брошюрой. Многое из этого проекта реализовывалось уже советской властью.

Несмотря на слабое здоровье, он, как всегда, успевал совершать сразу много дел. В 1916 году по предложению министра торговли и промышленности князя Шаховского Ефим Лукьянович занял место председателя вновь организованного Комитета по делам бумажной промышленности. Умение работать, казалось бы, в самых неблагоприятных условиях, было одной из его благороднейших черт. Эта отстраненная от политики деловитость притягивала к нему людей, делая его всегда нужным.

23 февраля 1917 года началась Февральская революция. «Устои старого режима так подгнили, что достаточно было незначительного толчка, чтобы он пал», – писал в своих воспоминаниях об этом времени Е.Л. Зубашев. 27 февраля 1917 года Высочайшим Указом деятельность Государственного Совета была приостановлена.

3 марта был сформирован первый состав Временного правительства, представленного партиями кадетов, октябристов и группой членов Государственного Совета. Одной из основных задач вновь образовавшегося Временного правительства была организация местных управлений. Предоставляя большую самостоятельность местным самоуправлениям, Временное правительство считало необходимым назначить правительственных комиссаров из местных общественных деятелей. Для выполнения этой задачи в Томскую и Красноярскую губернии был командирован в качестве правительственного комиссара член Государственного Совета Е.Л. Зубашев. Местные власти были уведомлены об этом правительственными телеграммами.