К началу занятий Е.Л. Зубашеву удалось организовать прекрасную институтскую библиотеку. Это была первая техническая библиотека в Сибири. Но ее тематика была значительно шире, в том числе научно-познавательного характера. Еще до приезда первых преподавателей директором были выписаны важнейшие сочинения по отделам математики, теоретической и прикладной механики, физики и химии.

Особой удачей была приобретенная им библиотека секретаря Петербургского горного учебного комитета, горного инженера С.Н. Кулибина в количестве 2 157 книг за 1500 рублей. Среди его собрания были такие уникальные книги, как прижизненные издания М.В. Ломоносова «Первые основания металлургии или рудных дел», «Явление Венеры на Солнце», «Рассуждения о большой точности морского пути» и С. Палласа «Путешествия по разным провинциям Российской империи». Издания 1773, 1776 гг. на русском и немецком языках и др. Первоначальный фонд библиотеки насчитывал 6000 экземпляров. В 1903 году Е.Л. Зубашеву удалось заполучить книги из библиотек Колывано-Воскресенских заводов. Эти две коллекции составляют и ныне основной фонд редких книг Научно-технической библиотеки ТПУ.

Активно участвовали в формировании библиотечного фонда профессора А.Э. Сабек, А.И. Ефимов, В.А. Обручев и другие, состоявшие членами библиотечного комитета, совмещая преподавательскую деятельность с обязанностями помощника библиотекаря. И сегодня НТБ ТПУ носит имя академика В.А. Обручева.