Прохорец Е.К. регулярно участвует в научно-методических и практических семинарах и конференциях в г. Томске, Москве и за рубежом, имеет сертификаты, дипломы и свидетельства государственного образца всероссийского и международного уровня. Прохорец Е.К. работала в составе научно-исследовательских коллективов по разработке проектов КПР ТПУ 2000, 2001 и 2002.

Областью научных интересов являются проблемы преподавания ИЯ в высшей школе, развитие автономности студентов, обучение автономным стратегиям и тактикам овладения иностранным языком, использование инновационных технологий и методик, в том чисел проектный методического обучения на основе междисциплинарных проектов.