Бернатонис, П. В. Гидрогеологические и инженерно-геологические условия отработки месторождений торфа / П. В. Бернатонис // Проблемы гидрогеологии, инженерной геологии и гидрогеоэкологии : материалы Всероссийской научной конференции, посвященной 80-летию кафедры гидрогеологии, инженерной геологии и гидроэкологии Томского политехнического университета, г. Томск, октябрь 2010 г. / Национальный исследовательский Томский политехнический университет (ТПУ), Институт природных ресурсов (ИПР) ; под ред. С. Л. Шварцева. — 2011. — С. 601-604
Инновационные аспекты добычи, переработки и применения торфа : материалы Международной конференции, посвященной 115-летию Национального исследовательского Томского политехнического университета, 18-20 октября 2011 г., г. Томск / Национальный исследовательский Томский политехнический университет (ТПУ) ; Инновационные аспекты добычи, переработки и применения торфа, Международная конференция ; отв. за вып. П. В. Бернатонис , О. А. ПаськоТомск : Изд-во ТПУ, 2011. — 184 с. : ил.
Бернатонис, П. В. Экологическая оценка проектов разработки месторождений торфа / П. В. Бернатонис // Проблемы гидрогеологии, инженерной геологии и гидрогеоэкологии : материалы Всероссийской научной конференции, посвященной 80-летию кафедры гидрогеологии, инженерной геологии и гидроэкологии Томского политехнического университета, г. Томск, октябрь 2010 г. / Национальный исследовательский Томский политехнический университет (ТПУ), Институт природных ресурсов (ИПР) ; под ред. С. Л. Шварцева. — 2011. — С. 206-210
Анализ плотности сети зондирования торфяных залежей (на примере торфяных месторождений Томской области) / В. К. Бернатонис [и др.] // Проблемы и перспективы развития минерально-сырьевой базы и предприятий ТЭК Сибири : материалы межрегиональной научно-практической конференции, 2009 г. г. Томск / Томская область, Администрация; Сибирский Федеральный округ; Томский государственный университет (ТГУ); Томский политехнический университет (ТПУ); под ред. В. Г. Емешева. — 2009. — С. 167-171
Сапропелевые ресурсы Томской области и перспективы их освоения / В. К. Бернатонис [и др.] // Высокие технологии добычи, глубокой переработки и использования болотно-озерных отложений : тезисы докладов международной научно-практической конференции, Томск, 12-15 марта 2003 г. — 2003. — С. 15-16
Сапропели как сопутствующие полезные ископаемые на торфяных месторождениях Томской области / В. К. Бернатонис [и др.] // Проблемы геологии и географии Сибири : материалы научной конференции, посвященной 125-летию основания Томского государственного университета и 70-летию образования геолого-географического факультета 2-4 апреля 2003 г. / ТГУ. — 2003. — Вып. 3 (III): Геохимия и минералогия. Петрология. Металлогения. Геология и экономика минерального сырья. — С. 213-215
Бернатонис, П. В. Минералого-химические особенности продуктов переработки руд золота Зун-Холбинского месторождения / П. В. Бернатонис, С. К. Кныш // Региональная геология. Геология месторождений полезных ископаемых : Материалы Международной научно-технической конференции "Горно-геологическое образование в Сибири. 100 лет на службе науки и производства" (Томск, 2001 г.). — Томск, 2001. — С. 188-193
Кныш, С. К. Самородное золото Зун-Холбинского месторождения / С. К. Кныш, П. В. Бернатонис // Региональная геология. Геология месторождений полезных ископаемых : Материалы Международной научно-технической конференции "Горно-геологическое образование в Сибири. 100 лет на службе науки и производства" (Томск, 2001 г.). — Томск, 2001. — С. 234-239
Савичев, О. Г. Гидрологическое обоснование хозяйственного освоения торфяных болот (на примере водосбора реки Ключ, Западная Сибирь) / О. Г. Савичев, П. В. Бернатонис, В. К. Бернатонис // Известия Томского политехнического университета [Известия ТПУ] / Томский политехнический университет (ТПУ). — 2012. — Т. 321, № 1: Науки о Земле. — [С. 155-162]. — URL: http://earchive.tpu.ru/bitstream/11683/4334/1/bulletin_tpu-2012-321-1-23.pdf
Бернатонис, В. К. Концепция освоения ресурсов торфа в современных экономических условиях (на примере Томской области) / В. К. Бернатонис, П. В. Бернатонис // Известия Томского политехнического университета [Известия ТПУ] / Томский политехнический университет (ТПУ). — 2010. — Т. 316, № 1: Науки о Земле. — [С. 161-163]. — URL: http://www.lib.tpu.ru/fulltext/v/Bulletin_TPU/2010/v316/i1/28.pdf
Микрофлора сапропелевых озер Томской области / В. К. Бернатонис [и др.] // Известия Томского политехнического университета [Известия ТПУ] / Томский политехнический университет (ТПУ). — 2002. — Т. 305, вып. 6 : Геология, поиски и разведка полезных ископаемых Сибири. — [С. 337-347]. — URL: http://www.lib.tpu.ru/fulltext/v/Bulletin_TPU/2002/v305/i6/29.pdf
Бернатонис, В. К. Геохимическая роль микроорганизмов в формировании зоны окисления олимпиадинского Золоторудного месторождения / В. К. Бернатонис, Н. А. Трифонов, П. В. Бернатонис // Материалы региональной конференции геологов Сибири Дальнего Востока и Северо-Востока России. — 2000. — Т. 2 Металлогения и полезные ископаемые. Геоэкология. Палеонтология и стратеграфия. Геоинформатика. Геофизические методы. — С. 11-12
Химический состав вод сапропелевых озер Томской области / П. В. Бернатонис [и др.] // Известия Томского политехнического университета [Известия ТПУ] / Томский политехнический университет (ТПУ). — 2011. — Т. 319, № 1 : Науки о Земле. — [С. 187-190]. — URL: http://www.lib.tpu.ru/fulltext/v/Bulletin_TPU/2011/v319/i1/32.pdf
Бернатонис, П. В. Технологическое обоснование кондиций для подсчета запасов месторождений торфа / П. В. Бернатонис // Известия Томского политехнического университета [Известия ТПУ] / Томский политехнический университет (ТПУ). — 2011. — Т. 319, № 1 : Науки о Земле. — [С. 78-82]. — URL: http://www.lib.tpu.ru/fulltext/v/Bulletin_TPU/2011/v319/i1/13.pdf
Бернатонис, П. В. Проект новой стадийности геологоразведочных работ на торф / П. В. Бернатонис // Известия Томского политехнического университета [Известия ТПУ] / Томский политехнический университет (ТПУ). — 2010. — Т. 317, № 1: Науки о Земле. — [С. 51-56]. — URL: http://www.lib.tpu.ru/fulltext/v/Bulletin_TPU/2010/v317/i1/09.pdf
Бернатонис, П. В. Состав микрофлоры в зоне окисления Олимпиадинского золоторудного месторождения / П. В. Бернатонис, Н. А. Трифонова ; Томский политехнический университет (ТПУ) // Обской вестник : научно-практический журнал / Комитет России по водному хозяйству ; Сибирское соглашение ; Обской бассейновый совет ; Российская академия наук (РАН), Сибирское отделение (СО), Институт водных и экологических проблем (ИВЭП) ; Водоканал Барнаула ; Ноосфера. — 1999. — № 3/4. — С. 97-99
Бернатонис, П. В. Зона окисления Олимпиадинского прожилково-вкрапленного золото-сульфидного месторождения : автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата геолого-минералогических наук / П. В. Бернатонис ; Томский политехнический университет; науч. рук.: А. Ф. КоробейниковТомск : [Б. и.], 1999. — 1 файл (317 Kb). — URL: http://www.lib.tpu.ru/fulltext/a/2002/39s.pdf
Бернатонис, П. В. Зона окисления Олимпиадинского прожилково-вкрапленного золото-сульфидного месторождения : диссертация на соискание ученой степени кандидата геолого-минералогических наук / П. В. Бернатонис ; Томский политехнический университет ; науч. рук. А. Ф. КоробейниковТомск, 1999. — 195 л.
Бернатонис, П. В. Зона окисления Олимпиадинского прожилково-вкрапленного золото-сульфидного месторождения : автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата геолого-минералогических наук / П. В. Бернатонис ; Томский политехнический университет; научн. рук. А. Ф. КоробейниковТомск : [Б. и.], 1999. — 19 с.
Бернатонис, П. В. Условия формирования комплексного золото-платиноидного Зун-Холбинского месторождения (В. Саян) / П. В. Бернатонис ; науч. рук. А. Ф. Коробейников // Проблемы геологии и освоения недр : материалы докладов Второй Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых им. академика М. А. Усова / Томский политехнический университет ; под ред. Б. Д. Васильева. — 1998. — Ч. 1. — С. 158