В 2003-2004 гг. принимала участие в гранте Министерства образования РФ «Образовательный округ как механизм управления качеством образования сельских образовательных учреждений»

В 2004 году авторская программа Е.Ю. Азбукиной «Рефлексивная деятельность педагога как фактор повышения качества образования» удостоена диплома победителя Областного Тендера программ повышения квалификации работников образования Департамента общего образования.

В 2005 году учебно-методическое пособие «Рефлексивная деятельность педагога» стало лауреатом конкурса «Лучшая научная книга 2005 года» в номинации «Психология и педагогика», проводимого Фондом развития отечественного образования в г. Сочи.

В 2004-2005 гг. принимала активное участие в реализации гранта РГНФ «Теоретико-методологическое обоснование технологии подготовки специалиста квалификации «Учитель малокомплектной школы».

В 2007 году за книгу «Основы специальной педагогики и психологии» Елена Юрьевна совместно с соавтором получили Диплом лауреата конкурса на лучшую научную книгу 2007 года, проводимого Фондом развития отечественного образования.