Родился 24 февраля 1940 г. – кандидат технических наук, профессор, академик РАМНТ, профессор кафедры промышленной и медицинской электроники Томского политехнического университета.

В 1962 г. окончил Томский политехнический институт (ТПУ). Ученая степень кандидата технических наук присуждена диссертационным советом Томского политехнического института (ныне Томский политехнический университет (ТПУ) в 1967 г. Ученое звание профессора по кафедре биологической и медицинской кибернетики присвоено в 2006 г.

Является учеником ректора ТПИ в 1944 - 1970 гг. профессора А.А. Воробьева. Доцент, впоследствии – профессор кафедры промышленной и медицинской электроники ТПУ.

С 1987 г. начал работать в СибГМУ, где в 1989 г. создал кафедру медицинской и биологической кибернетики и возглавляет ее до 2015 года. Трудовая жизнь Я.С. Пеккера связана с томским научно-образовательным комплексом.