За время научно-преподавательской деятельности Трубникова Н.В. получала международные гранты (Дома наук о человеке (Париж, Франция) и Посольства Франции в России), в 2001, 2002, 2006 годах проходила стажировку в Высшей школе социальных исследований (Париж, Франция). Принимала активное участие в работе международных научных конференциях, в том числе, в ТГУ (Томск), СГУ (Саратов), Смольном колледже свободных искусств и наук (Санкт-Петербург), НГТУ (Новосибирск), Ассоциации исследователей российского общества (Москва)), Федеральном сибирском университете (г. Красноярск) была участницей летней школы «Рождение национальной монархии в России», (EHESS-ИВИ РАН, Париж).

С декабря 2004 года по ноябрь 2007 г. Н.В. Трубникова находилась в докторантуре при кафедре истории древнего мира, средних веков и методологии истории ИФ ТГУ, в ноябре 2007 г. успешно защитила докторскую диссертацию. Диплом доктора исторических наук получен в июне 2008 г.

Ее научные результаты актуальны, имеют научную новизну, практическую и научную ценность. В целом по результатам деятельности Н.В. Трубниковой опубликовано 40 научных трудов, в числе которых одна научная монография, 25 статей, из них 12 – в изданиях, признаваемых ВАК. Н.В. Трубникова удостоена первой премии в конкурсе «Ученый года ТПУ-2007».