Ивашкина Е.Н. работает штатным преподавателем в отделении химической инженерии Томского политехнического университета в должности ассистента с сентября 2005 года.
С марта 2008 г. по декабрь 2013 г. – в должности доцента кафедры. С декабря 2013г. по настоящее время работает в должности профессора.
За время своей преподавательской деятельности подготовлены учебно-методические комплексы и прочитаны курсы лекций по следующим дисциплинам: «Современные проблемы химической технологии» (магистратура, направление 240100), «Теоретические основы химической технологии топлива и углеродных материалов» (бакалавриат, направление 240100), «Технология переработки нефти, попутного и природного газов» (магистратура, направление 240100), «Химическая технология топлива и углеродных материалов» (бакалавриат, направление 240100), «Инновационное развитие химической технологии природных энергоносителей» (магистратура, направление 240100), «Основные процессы и аппараты химических производств» (магистратура, направление 241000).
Руководит дипломными, выпускными квалификационными работами и магистерскими диссертациями (ежегодно под ее руководством выпускаются 3–4 человека).
По результатам своей научной и преподавательской деятельности Ивашкина Е.Н. награждена дипломом II степени в университетском смотре-конкурсе научно-методических работ в номинации "Лучший УМКД" по дисциплине "Переработка нефти и газа" (2015 г.). В 2014 г. была награждена почетной грамотой мэра г. Томска за большой вклад в развитие научных исследований, подготовку высококвалифицированных специалистов и в связи с Днем российской науки.