Накладные от научно-технических программ и грантов расходуются на реализацию общеуниверситетских мероприятий: содержание служб научного управления (ФЗП); командировки сотрудников управления, молодых ученых и студентов; выплата пошлин за патентование; вознаграждение ученых за эффективное руководство аспирантами, написание статей с высоким ИФ, патенты на изобретения, проведение внутриуниверситетских конкурсов (Ученый года, Лучшая НИР (монография, сборник статей и др.), проведение конференций и выставок различного уровня; приобретение канцтоваров и расходных материалов и др. Одним из важнейших направлений «Программы повышения конкурентоспособности Национального исследовательского Томского политехнического университета среди ведущих мировых научно-образовательных центров» и использования накладных средств ТПУ является привлечение талантливой молодежи в университет, развитие академической мобильности студентов, аспирантов и молодых ученых, в т.ч. из ведущих иностранных университетов. Кроме того, необходимо учесть, что удаленность г. Томска от Европейской части России ведет к увеличению командировочных расходов, повышенному районному коэффициенту (30%) и т.д.