Научный отдел организован в структуре Института физики высоких технологий  Томского политехнического университета в 2010 году.

Основной задачей работы отдела является проведение информационно-организационных мероприятий в области научно-исследовательской работы, эффективное содействие выполнению научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ и инновационных проектов коллективами и подразделениями института, а также интеграции научных коллективов кафедр и лабораторий для выполнения совместных междисциплинарных проектов:

• организация выполнения проектов в рамках государственного задания НИР Министерства образования и науки РФ, Федеральных целевых программах и грантах;
• организация выполнения НИОКР по хозяйственным договорам с предприятиями и организациями различной формы собственности;
• координация выполнения НИОКР кафедр и научных лабораторий ИФВТ, а также междисциплинарных и межПНРовских научных проектов в рамках университета;
• разработка перспективных планов и показателей научно-инновационной деятельности подразделений института и контроль их выполнения;
• организация информационного научного обмена между подразделениями института
• организационная, консультационная и информационная поддержка научных коллективов, сотрудников, преподавателей, аспирантов, докторантов и студентов института;
• организация работ по вовлечению в НИР студентов и магистратов ИФВТ
• координация работы кафедр и научных лабораторий по вопросам подготовки аспирантов и докторантов;
• контроль исполнения указаний и нормативных документов вышестоящих организаций по научной и инновационной деятельности.
• составление отчетов, справок подготовка информации по результатам научной и инновационной деятельности института.
• организация представления разработок института на выставки-ярмарки различного уровня, в том числе в Выставочном центре ТПУ.